Meriympäristöön liittyvät kysymykset eivät kunnioita valtioiden rajoja, ja tästä syystä ehdotetun meristrategiadirektiivin toteutuksessa tarvitaan tehokasta yhteistyötä myös kolmansien, samojen merialueiden piiriin kuuluvien valtioiden kanssa. Komission ehdotuksessa painotetaankin aluemeriä koskevien yleissopimusten tärkeyttä. Strategia ja aluemeriä koskevat yleissopimukset tukevat toinen toisiaan:

— strategian onnistuminen riippuu siitä, miten tehokkaasti jäsenvaltiot tekevät yhteistyötä ja pystyvät koordinoimaan toimintaa sekä keskenään että kolmansien valtioiden kanssa. Paras foorumi yhteistyölle ovat aluemeriä koskevat yleissopimukset. Helcomin pitkä kokemus tieteellisestä ja teknisestä osaamisesta Itämeren alueella, yhdessä koko Itämeren alueen kattavan toiminnan kanssa – mukana ovat kaikki yhdeksän rantavaltiota, mukaanluettuna Venäjä, ja yhteistyötä tehdään myös valuma-alueeseen kuuluvien valtioiden kanssa – sekä osoitettu kyky toimia tehokkaasti alueellisella tasolla tekevät Helcomista korvaamattoman yhteistyökumppanin strategian toteutuksessa. Yhteistyö kaikkien Itämereen rajoittuvien valtioiden kesken on välttämätön edellytys onnistuneelle alueen meriympäristön suojelulle;
 
— ehdotettu meristrategiadirektiivi vahvistaa myös osaltaan aluemeriä koskevia yleissopimuksia, sillä se tarjoaa selkeät, oikeudellisesti valvottavissa olevat puitteet, joissa jäsenvaltiot voivat toimia. Tämä vuorostaan tukee EU:n vaikutusvaltaa niissä kolmansissa maissa, joiden kanssa se jakaa yhteisiä merialueita.

(1) KOM(2005)505 lopullinen.